両目が頭部の前面に位置しており、上下にも僅かにずれている。フクロウの眼球は眼窩に固定されているため、眼球を動かせない。その代わり、頭を真後ろに向けたり、上下を反転させたり、自由に回転させることができる。これは頚骨が12〜14本と多く（人間を含め、主な哺乳類は7本）、回しやすい構造をもっているためである。
ワシのような形をしたくちばしをもつ。目の周囲を縁取るようにはっきりとした顔盤という羽毛が生えた部位がある。耳角と呼ばれる耳のように見える羽は耳ではなく、耳は顔盤のすぐ後ろに位置している。耳の位置は左右で異なっている。
足趾のうち、一番外側の第４趾の関節が非常に柔軟で、多くの鳥類のような前３本後１本だけでなく、前２本後２本という足趾の配列に切り替えることができる。
種類によっては、刺激を受けると、外見上の体の大きさを変えるものもいる。
